La decorazione della Chiesa superiore non è un unico "affresco di Giotto". Le fonti nominano Cimabue e Maestro Oltremontano nel presbiterio e transetto, Jacopo Torriti e altri pittori nei registri alti, e ventotto scene francescane nel registro basso della navata. Il Ministero distingue anche storie dell'Antico e Nuovo Testamento, Evangelisti, Dottori della Chiesa, scene absidali, vetrate e mani di bottega. Ciclo, scena, vela, finestra, iscrizione e restauro possono richiedere record propri.7,5,3,6
L'autografia del ciclo francescano resta contestata. La Custodia riferisce che alcuni studiosi lo assegnano a Giotto e altri a una scuola romana; il Ministero usa Giotto e altri maestri. Non è prova che ogni scena sia stata dipinta personalmente da Giotto. Il testo pubblico conserva il dibattito e attribuisce una scena solo con catalogo o autorità puntuale.7,5,6
Cimabue, Maestro Oltremontano, Torriti, Maestro di Isacco, Maestro della Cattura e altre botteghe non sono alias di Giotto. Anche le vetrate sono opere, non riempitivi. L'inventario senza tetto riconcilia autore, bottega, confini della scena, supporto, data, tecnica, iconografia, stato, restauro, proprietario, custode, posizione e diritti.7,5,6,13,4,14